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Software

Software Instalado en el SC3
Software de código abierto:
  • OpenMPI: Biblioteca de funciones para programación paralela en el modelo de memoria distribuida.
  • CUDA: Biblioteca de funciones para programación paralela en el modelo de GPU
  • Compiladores: GNU, intel, PGI. Estos son programas que generan código ejecutable para distintos lenguajes de programación: C, C++, Fortran
  • Gromacs: Aplicación para dinámica molecular. Permite realizar simulación con ecuaciones newtonianas de movimiento para sistemas con ciento de millones de partículas.
  • Abinit: Es un programa que permite hallar: la energía total, densidad de carga y la estructura electrónica de sistemas que constan de electrones y núcleo (moléculas y sólidos periódicos) utilizando pseudopotenciales y oscilaciones de planos u ondas.
  • Clustalw: Aplicación que permite realizar el secuenciamiento de cadenas de proteinas y cadenas de ADN
  • Quatun-expresso: Es un conjunto de aplicaciones para el cálculo de estruturas electrónicas en el modelado de materiales a nivel de nano escala.
  • Madagascar: Es un paquete para análisis de datos multidimensionales. También se utiliza para el procesamiento de imágenes digitales y distintas áreas de geofísica.
  • Corsika: Es un programa para la simulación detallada de lluvia de rayos cósmicos.
  • R: Ambiente y lenguaje para cómputo estadístico y gráfico.
  • Anaconda: Es una distribución del lenguaje de programación python para el procesamiento a gran escala, análisis predictivo y cómputo científico.
  • Caffe: Es un ambiente de trabajo para el área de deep learning.
  • Charm: Biblioteca de funciones para la comunicación eficiente de objetos C++
  • slurm: Es un calendarizador de ejecución de tareas en ambientes de clúster.
Software privado
  • Vasp: Es un  programa para modelado de materiales a nivel atómico. Sirve para realizar cálculo de estructuras electrónicas y dinámica molecular.
  • Comsol: Es una plataforma de propósito general basada en métodos numéricos para el modelado y simulación de problemas físicos.